Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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TTF1Q15361 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TTF1Q15361 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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