Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms