Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
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