Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
MDC1Q14676 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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