Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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