Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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