Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL3Q13618 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL3Q13618 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL3Q13618 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CUL3Q13618 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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CUL3Q13618 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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CUL3Q13618 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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CUL3Q13618 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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CUL3Q13618 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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CUL3Q13618 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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CUL3Q13618 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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CUL3Q13618 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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CUL3Q13618 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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