Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CUL1Q13616 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms