Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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