Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TOP3AQ13472 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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