Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
MKRN4PQ13434 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
MKRN4PQ13434 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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