Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms