Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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SKP2Q13309 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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SKP2Q13309 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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SKP2Q13309 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
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SKP2Q13309 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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SKP2Q13309 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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SKP2Q13309 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
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SKP2Q13309 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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SKP2Q13309 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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SKP2Q13309 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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