Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CBX3Q13185 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CBX3Q13185 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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