Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ACACAQ13085 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ACACAQ13085 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ACACAQ13085 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ACACAQ13085 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.47
ACACAQ13085 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ACACAQ13085 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms