Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RBBP4Q09028 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms