Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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PGGT1BP53609 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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PGGT1BP53609 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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