Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXD11P31277 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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