Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HOXD10P28358 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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