Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPREP23469 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPREP23469 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPREP23469 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPREP23469 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPREP23469 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPREP23469 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPREP23469 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPREP23469 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPREP23469 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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PTPREP23469 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPREP23469 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPREP23469 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPREP23469 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPREP23469 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPREP23469 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPREP23469 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPREP23469 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPREP23469 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPREP23469 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPREP23469 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPREP23469 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPREP23469 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPREP23469 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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