Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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PTPRDP23468 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
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