Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
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PTPRBP23467 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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PTPRBP23467 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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PTPRBP23467 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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PTPRBP23467 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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PTPRBP23467 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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PTPRBP23467 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
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PTPRBP23467 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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