Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRCP08575 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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PTPRCP08575 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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PTPRCP08575 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRCP08575 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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PTPRCP08575 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
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PTPRCP08575 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRCP08575 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRCP08575 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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PTPRCP08575 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRCP08575 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRCP08575 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
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