Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ALKQ9UM73 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms