Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms