Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED13Q9UHV7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms