Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms