Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH5

Nme5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme5Q99MH5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme5Q99MH5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme5Q99MH5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme5Q99MH5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme5Q99MH5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme5Q99MH5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme5Q99MH5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme5Q99MH5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme5Q99MH5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme5Q99MH5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme5Q99MH5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms