Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms