Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms