Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r196Q5SVD5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms