Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ulk3Q3U3Q1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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