Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms