Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIK5Q16478 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK5Q16478 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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