Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms