Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DEUP1Q05D60 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms