Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crnkl1P63154 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms