Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SBF1O95248 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SBF1O95248 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SBF1O95248 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SBF1O95248 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SBF1O95248 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SBF1O95248 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SBF1O95248 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SBF1O95248 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SBF1O95248 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SBF1O95248 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SBF1O95248 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SBF1O95248 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SBF1O95248 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SBF1O95248 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBF1O95248 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBF1O95248 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBF1O95248 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SBF1O95248 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBF1O95248 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SBF1O95248 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBF1O95248 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBF1O95248 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBF1O95248 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBF1O95248 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SBF1O95248 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SBF1O95248 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBF1O95248 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBF1O95248 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBF1O95248 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBF1O95248 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms