Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPHP4O75161 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP4O75161 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms