Protein–RNA interactions for Protein: O70496

Clcn7, H(+)/Cl(-) exchange transporter 7, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn7O70496 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clcn7O70496 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clcn7O70496 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clcn7O70496 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clcn7O70496 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clcn7O70496 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clcn7O70496 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clcn7O70496 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcn7O70496 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcn7O70496 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcn7O70496 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Clcn7O70496 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcn7O70496 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clcn7O70496 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcn7O70496 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcn7O70496 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clcn7O70496 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcn7O70496 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcn7O70496 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcn7O70496 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcn7O70496 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcn7O70496 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcn7O70496 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcn7O70496 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clcn7O70496 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clcn7O70496 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clcn7O70496 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clcn7O70496 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn7O70496 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn7O70496 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn7O70496 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcn7O70496 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn7O70496 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn7O70496 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn7O70496 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn7O70496 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn7O70496 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn7O70496 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn7O70496 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn7O70496 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn7O70496 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn7O70496 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn7O70496 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn7O70496 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn7O70496 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms