Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BckdkO55028 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BckdkO55028 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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BckdkO55028 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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BckdkO55028 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BckdkO55028 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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BckdkO55028 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BckdkO55028 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BckdkO55028 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BckdkO55028 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BckdkO55028 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BckdkO55028 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BckdkO55028 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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BckdkO55028 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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BckdkO55028 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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