Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTATSF1O43719 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms