Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLRMTO00411 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms