Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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