Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HCN3Q9P1Z3 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HCN3Q9P1Z3 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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