Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TM7SF3Q9NS93 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
TM7SF3Q9NS93 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms