Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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HOXD1Q9GZZ0 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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HOXD1Q9GZZ0 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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HOXD1Q9GZZ0 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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HOXD1Q9GZZ0 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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HOXD1Q9GZZ0 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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