Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXQ1Q9C009 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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FOXQ1Q9C009 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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FOXQ1Q9C009 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
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FOXQ1Q9C009 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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FOXQ1Q9C009 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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