Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
UBR3Q6ZT12 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms