Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
C9orf135Q5VTT2 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.9 ms